济医附院组织人员对３年内收治的病例进行分析，采集数据，结合现行政策规定的价格标准计算出相应费用，根据治疗成本确定此病种的限价金额，并向社会公布。实行限价的病种主要是常见病、多发病，根据技术水平可以控制疗效和病程，病情和预后的标准容易判定。患者据此标准事先付费，超出部分由医生或院方承担。
医院还组织最具权威的专家和有关部门整合原有诊疗方案，从确保医疗质量和合理利用医疗资源出发，制订此病种最基本的临床路径，包括住院天数、所用药品、检查项目、手术麻醉方式等，减少随意性，将治疗行为纳入规范化轨道。根据多年用药情况，济医附院核定了１１３４种常用药，将那些药价虚高、回扣大的药品清理出去。
实行单病种限价，将按项目收费的后付费制改为按病种收费的预付费制，使医疗费用有了较大幅度降低。据医院方面提供的数据，实行限价的１２８个病种的医疗费用平均降幅达３３％，特殊病种降幅达４０％。以心胸外科四种先天性心脏病为例，原来，心脏房间隔缺损、室间隔缺损、肺动脉狭窄、动脉导管未闭四种疾病每例平均医疗费用在１．８万元左右，现在限价１万元。
医疗费用封顶，迫使医院各科室和医生努力降低医疗成本，在选择药物、材料、检查项目时“只选对的不选贵的”。以限价前后两名心脏房间隔缺损病人使用抗生素情况为例，限价前的病人，术后使用９天先锋必素，计１３６８元；限价后的病人，术后使用６天先锋霉素Ⅶ，计１９２元。治疗同一病种，仅使用抗生素的费用就减少１１７６元。在１２８个限价病种中，药品收入仅占总费用的１０％。
据山东省卫生厅通报的数据，济医附院开始实施限价的当年，急性胰腺炎、腰椎间盘突出（手术）、前列腺增生、剖宫产４种疾病的住院费用，分别比全省１６所医疗机构平均住院费用低６２５．７元、９４０．５元、８８７元、５８４．４元。
济医附院采取的限价措施，确立了医院新的发展方式，不再靠增加病人的医疗费用转而靠降低医疗门槛吸引病人就诊来增加医院收入，从而带动了医院的快速发展。２００３年到２００８年，济医附院门诊量年均增长３０．２％，出院病人年均增长３９．８％，病房手术量年均增长５６．２％，医院的业务收入年均增长７０．８％。
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