石菖蒲根瘦节密，一寸九节为良，古时处方往往写九节菖蒲，认为疗效较好。但现在市上所用的九节菖蒲原料是毛艮科阿尔泰银莲花（菊形双瓶梅）的根茎，与石菖蒲是两种不同的植物，不宜混用。